Uso de herramientas de visualización de datos en hojas de datos SEND: un gráfico vale mil puntos de datos

SEND [Standard for Exchange of Nonclinical Data] es mucho más que una herramienta  Envío de pruebas según SEND con la ayuda de Covance. Foto de un código binariopara facilitar el envío de datos preclínicos a la FDA. Las bases de datos SEND están repletas de información, aunque en un formato lento de analizar para los no expertos. Con las herramientas de visualización adecuadas, los conjuntos de datos SEND pueden aportar información muy útil para los programas preclínicos e ideas importantes.

¿De qué me servirán las herramientas de visualización de datos al usar SEND?

La terminología controlada es útil para presentar datos, puesto que dan a los investigadores la capacidad de ahondar en los detalles del estudio de manera más exhaustiva. Al usar una herramienta de visualización se puede reducir drásticamente el tiempo necesario para analizar los resultados de patología anatómica. Como los datos son cuantitativos por naturaleza, la capacidad de cuantificar, codificar por colores, agrupar y ordenar permite visualizar los datos fácilmente por reconocimiento de patrones, detección de tendencias e identificación externa.

Estos son algunos ejemplos de cómo la visualización puede ayudar a leer los datos más fácil y rápido:

Ejemplo 1: visualización de efectos secundarios reportados en conjunto de datos SEND

La imagen 1 de abajo muestra observaciones posiblemente preocupantes de un estudio: cinco sujetos masculinos que sufren de "nefropatía, progresiva crónica - grave"; cuyos detalles se ampliaron en una tabla para los sujetos afectados.

Imagen de cuadro que muestra datos de visualización de efectos secundarios reportados en conjunto de datos SEND

Imagen 1. Visualización de efectos secundarios observados reportados en conjunto de datos SEND.

Ejemplo 2: Informe de efectos secundarios en un modelo de investigación individual

La imagen 2 muestra a un sujeto singular del estudio que los investigadores seleccionaron para analizar más a fondo otros tejidos o resultados. Con esta función los investigadores pueden caracterizar los resultados de un sujeto individual para identificar tendencias en efectos secundarios clínicos.

Imagen 2. Informe de efectos secundarios observados en un modelo de investigación individual.

Ejemplo 3: Resumen de parámetros preclínicos del conjunto de datos SEND

Antes de la visualización

Sin ningún tipo de asistencia para visualizar los datos, el estudio SEND de abajo (tabla 1) muestra un parámetro clínico (PC) por página y un sexo por página. Pero esta página no es la única página de datos para hombres para este parámetro; de hecho, para reportar todos los resultados de resumen para hombres y mujeres para tres parámetros hacen falta 11 páginas.

Tabla 1. Resumen de parámetros clínicos del conjunto de datos SEND.

Los resultados individuales para los mismos tres parámetros abarcan 24 páginas. Todos los datos de PC en este estudio se reportan en más de 500 páginas del informe contribuyente de PC. Todo el informe del estudio tenía más de 1500 páginas . La extensión del documento hace que seguir los resultados para un sujeto de interés sea un proceso larguísimo; e interpretar los datos es una tarea nada intuitiva.

Después de la visualización

Para que los datos sean más fáciles de analizar, se los convirtió en una visualización. En la imagen 3, los mismos tres parámetros del conjunto de datos de arriba se resumieron en una misma pantalla, ordenados por ambos sexos combinados (arriba) y separados (abajo).

Como la herramienta de visualización es interactiva, los científicos pueden alternar fácilmente entre el resumen y los datos individuales, modelos de investigación individuales, diferentes parámetros, etc. También se puede seleccionar un solo sujeto para resaltar sus datos en todas las visualizaciones relacionadas.

Imagen 3. Visualización de conjunto de datos SEND.

Ejemplo 4: Observaciones clínicas de un conjunto de datos SEND

Antes de la visualización

En otro conjunto de datos de ejemplo, la tabla 2 indica la cantidad de sujetos con un resultado en cualquier punto durante el estudio; sin embargo, no indica cuántas veces se dictó un resultado.

La tabla de resumen se dividió por envío, por lo que los resultados en cada categoría se separaron en >10 páginas. La tabla de resumen tiene 20 páginas con cuadros individuales con una extensión de 424 páginas y todo el informe del estudio con una extensión de más de 2700 páginas.

Tabla 2. Resumen de observaciones clínicas de conjunto de datos SEND.

Después de la visualización

Usando herramientas de visualización de datos, toda la piel y pelaje se representan en una misma tabla (imagen 4). Las bandas indican cuántas veces se encontró el resultado para cada sujeto. Todos los resultados ahora se pueden ver en una misma pantalla, y el usuario puede filtrar los resultados seleccionando otros grupos, parámetros o sujetos individuales.

Imagen 4. Visualización de datos de un conjunto de datos SEND

¿Qué herramientas de visualización de datos puedo usar?

En Covance usamos herramientas de visualización de datos internamente para leer y comprender nuestros propios conjuntos de datos. Y usted puede hacer lo mismo con sus conjuntos de datos.

En el mercado se pueden encontrar puntajes de herramientas de visualización que pueden aceptar datos sin procesar y convertir largos informes de estudios en gráficos interactivos intuitivos. Investigue y recuerde buscar una herramienta que se adapte bien a los sistemas de datos que tiene.

Si tiene más preguntas sobre SEND o visualización de datos, contáctenos. O lea más sobre SEND en nuestro Centro de Información sobre SEND.